研究方向：
1. 染色质结构与功能
2. 生物信息学
3. 表观/三维基因组新型技术开发应用
主要研究内容和成果：
主要从事表观遗传学和生物信息学的前沿交叉研究，采用三维基因组、生物信息和分子遗传学等研究手段，围绕植物染色质高级结构、功能与演化等方面开展工作。通过自主研发系列表观技术，系统阐明植物染色质三维组织的动态调控规律，近五年以通讯/第一作者（含共同）在PNAS（2025）、Nature Communications（2020, 2024）、Molecular Cell（2024）和Science Advances（2020）等期刊发表论文11篇。
教育和工作经历：
2024年-至今，南京师范大学生命科学学院，特岗研究员
2021年-2023年，北京大学，博士后（导师：邓兴旺院士）
2015年-2020年，北京大学，理学博士（导师：钱伟强研究员和何航研究员）
2011年-2015年，南京师范大学，理学学士
科研项目：
1.国家自然科学基金青年科学基金项目（C类），2026年-2028年，主持；
2.江苏省自然科学基金青年基金项目，2025年-2028年，主持；
3.江苏省高校自然科学研究项目，2025年～2027年，主持；
4.南京师范大学优秀高层次人才（Ⅰ）科研启动基金，主持；
5.中国植物学会2024年度“青苗人才成长计划”；
6.山东省重点研发计划潍坊现代农业山东省实验室项目子课题，2023年-2024年，主持；
主要学术兼职：
1. 中国植物学会会员、中国植物生理与分子生物学学会会员
3. 国家自然科学基金委员会函评专家
4. aBIOTECH期刊青年编委
5. 多次为Advanced Science、New Phytologist、PCE、PLoS computational biology等期刊审稿人
奖项：
中国植物学会-吴征镒植物学奖新锐奖
近五年代表性学术论文：（#共同第一作者，*通讯作者）
1. Lei Li#, Guanyu Chen#, Guangquan Zhu, Jili Wu, Xinglong Kui, Zihui Zhang, Lingyang Feng, Minghan Huang, Wenbo Hua, Zhipeng Qu, Lina Zou, Changmei Lu, Bojian Zhong, Hang He, Xing Wang Deng*, Linhua Sun*. Single-molecule views of chromatin accessibility and structure during photomorphogenesis. (2025). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (中科院一区TOP，IF=9.1)
2. Linhua Sun#, Jingru Zhou#, Xiao Xu#, Yi Liu, Ni Ma, Yutong Liu, Wenchao Nie, Ling Zou, Xing Wang Deng*, Hang He*. Mapping nucleosome-resolution chromatin organization and enhancer-promoter loops in plants using Micro-C-XL. (2024). Nature Communications（中科院一区TOP，IF=14.7）
3. Jiayue Shu#, Linhua Sun#, Dingyue Wang#, Xiaochang Yin#, Minqi Yang#, Zhijia Yang, Zheng Gao, Yali Liu, Guangmei Tian, Suxin Xiao, Huapeng Zhou, Yuehui He, Jizong Wang, Yuannian Jiao, Myriam Calonje, Jinsheng Lai, Xing Wang Deng, Hang He*, Yue Zhou*. EMF1 functions as a 3D chromatin organizer in Arabidopsis. (2024). Molecular Cell（中科院一区TOP，IF=14.5）
4. Linhua Sun#, Yuqing Jing#, Xinyu Liu#, Qi Li#, Zhihui Xue, Zhukuan Cheng, Daowen Wang, Hang He*, and Weiqiang Qian*. Heat stress-induced transposon activation correlates with 3D chromatin organization rearrangement in Arabidopsis. (2020). Nature Communications（中科院一区TOP，IF=14.7）
5. Linhua Sun#, Yuxin Cao#, Zhu Li#, Yi Liu, Xiaochang Yin, Xing Wang Deng*, Hang He*, and Weiqiang Qian*. Conserved H3K27me3-associated chromatin looping mediates physical interactions of gene clusters in plants. (2023). Journal of Integrative Plant Biology（中科院一区TOP，IF=9.3）
6. Wei Lin#, Linhua Sun#, Run-Zhou Huang, Wenjie Liang, Xinyu Liu, Hang He, Hiroo Fukuda, Xin-Qiang He*, and Weiqiang Qian*. Active DNA demethylation regulates tracheary element differentiation in Arabidopsis. (2020). Science Advances（中科院一区TOP，IF=11.7）
7. Zhu Li#, Linhua Sun#, Xiao Xu, Yutong Liu, Hang He*, Xing Wang Deng*. Light control of three‐dimensional chromatin organization in soybean. (2024). Plant Biotechnology Journal（中科院一区TOP，IF=10.1）
8. Jinjin Tong#, Zhitong Ren#, Linhua Sun#, Sixian Zhou, Yufan Hui, Dong Ci, Wei Yuan, Wei Wang, Liumin Fan, Zhe Wu, Weiqiang Qian*. ALBA proteins confer thermotolerance through stabilizing HSF mRNAs in cytoplasmic granules. (2022). Nature Plants（中科院一区TOP，IF=15.8）
9. Wenjie Liang#, Jinchao Li#, Linhua Sun#, Yi Liu, Zijun Lan, Weiqiang Qian*. Deciphering the synergistic and redundant roles of CG and non-CG DNA methylation in plant development and transposable element silencing. (2022). New Phytologist（中科院一区TOP，IF=8.3）
10. Tingting Yang#, Dingyue Wang#, Guangmei Tian#, Linhua Sun#, Xiaochang Yin, Jun Xiao, Yu Sheng, Danmeng Zhu, Hang He, and Yue Zhou*. Chromatin remodeling complexes regulate genome architecture in Arabidopsis. (2022). The Plant Cell（中科院一区TOP，IF=10.0）
11. Changzhi Huang#, Zekai Liu#, Yunlei Guo#, Wanchu Wang#, Zhen Yuan, Yusheng Guan, Deng Pan, Zhibin Hu, Linhua Sun*, Zan Fu*, Shuhui Bian*. scCancerExplorer: a comprehensive database for interactively exploring single-cell multi-omics data of human pan-cancer. (2025). Nucleic Acids Research（中科院二区，通讯作者，IF=16.6）
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