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尚广东

1986.9–1990.7 中国药科大学,药理学,学士

1990.8–1993.6  山东新华制药厂,质检处

1993.9–1996.7 中国药科大学,生物化学,硕士

1996.7–1999.7 中国医学科学院,微生物与生化药学,博士

1999.8–2001.12 中国医学科学院医药生物技术研究所,代谢工程室

2001.1–2003.8 美国华盛顿大学西雅图分校化学系博士后

2003.9–2004.8 美国康奈尔化学系博士后

2004.11 南京师范大学生命科学学院;2005.6 副教授;2020.7教授

 

主持国家自然科学基金面上项目3项和主任基金项目1项、“973”前期研究课题1项、十五“863”课题1项、十一五“863”课题1项以及十二五“863”子课题1项。共发表论文51篇,其中SCI收录23篇(10篇为通讯作者);获得11项发明专利授权

 

研究方向

医药中间体的酶催化、微生物药物学和微生物基因编辑

 

在研项目

国家自然科学基金面上项目:N-乙酰-D-葡萄糖胺2-异构酶的定向进化,项目号:820737422021-01-012024-12-31

 

代表论文#共同第一作者,*通讯作者)

[16] Wu M#, Xu Y#, Yang J, Shang G*. Homing endonuclease I-SceI-mediated Corynebacterium glutamicumATCC 13032 genome engineering.ApplMicrobiolBiotechnol. 2020,104(8):3597–3609. 首次将含有自剪切和消除元件的自杀载体运用于C. glutamicum ATCC 13032基因组工程,敲除片段至~13kb,敲除效率可达100%;以所敲入至染色体的抗性基因回复,研究了单链DNA重组工程的条件。有研究者(P.N.)在2020.3的一篇没有引用我的11及此论文的论文中提到不能构建此类自剪切消除质粒

[15] Gao X#, Zhang F#, Wu M, Wu Z, Shang G*. Production of N-acetyl-D-neuraminic acid by whole cells expressing Bacteroidesthetaiotaomicron N-acetyl-D-glucosamine 2-epimerase and Escherichia coli N-aetyl-D-neuraminicAacid aldolase.J Agric Food Chem. 2019,67(22):6285–6291.克隆了新型的N-乙酰-D-葡萄糖胺异构酶BT0453BT0453和醛缩酶偶联实现基于双质粒、单质粒以及染色体的全细胞酶催化得到N-乙酰-D-神经氨酸,最高催化效率达53.6%Google Scholar引用2

[14] Li J#, Sun J#, Gao X, Wu Z, Shang G*. Coupling ssDNA recombineering with CRISPR-Cas9 for Escherichia coli DnaG mutations.ApplMicrobiolBiotechnol. 2019, 103(8):3559–3570. 单链DNA重组工程和CRISPR/Cas9联合介导大肠杆菌必需基因DnaG的点突变,效率可达100%;基因编辑后,sgRNA表达质粒和cas9诱导表达质粒均可经自剪切单独或共同消除。Google Scholar引用2

[13] Wu Z, Chen Z, Gao X, Li J, Shang G*. Combination of ssDNA recombineering and CRISPR-Cas9 for Pseudomonas putida KT2440 genome editing.ApplMicrobiolBiotechnol. 2019, 103(6):2783–2795. 单链DNA重组工程和CRISPR/Cas9联合运用于KT2440基因敲除,只需构建中等拷贝的sgRNA表达质粒,基因敲除最大片段9.4kb,敲除和点突变的效率均可达100%Google Scholar引用5

[12]Zhang Q, Yan Z, Xu Y, Sun J, Shang G*. Characterization of Inducible ccdB Gene as a Counterselectable Marker in Escherichia coli Recombineering.CurrMicrobiol. 2017, 74(8):961–964. 构建了容纳R6K复制子和毒性基因ccdB的菌株E.coli LS027,构建了IPTG诱导ccdB毒性基因体系;首次报道了以自剪切和消除质粒(Self-cleavage and elimination (SCE) plasmid)消除菌株已有的质粒并自剪切消除。SCE质粒的特征是质粒上克隆有诱导表达的归巢核酸酶基因I-SceII-SceI识别位点。Google Scholar引用6

[11] Chen Z, Ling W, Shang G*. Recombineering and I-SceI-mediated Pseudomonas putida KT2440 scarless gene deletion.FEMS Microbiol Lett.2016, 363(21).pii: fnw231.首次实现重组工程和归巢核酸酶I-SceI介导的KT2440无痕基因敲除,只需电转OE-PCR所得线性打靶DNA。最大敲除片段54.8 kb,效率可达100%5个大片段敲除后,基因组削减3.76%Google Scholar引用12

[10]Luo X#, Yang Y#, Ling W, Zhuang H, Li Q, Shang G*.Pseudomonas putida KT2440 markerless gene deletion using a combination of λ Red recombineering and Cre/loxP site-specific recombination.FEMS Microbiol Lett.2016, 363(4).pii: fnw014.首次实现KT2440重组工程联合位点特异性重组体系Cre/loxP介导的KT2440无抗基因敲除,最大敲除片段9.4kb,效率可达100%。系统效率~10–7,而2017VdL测试本系统的效率~10–3,高出近万倍。Google Scholar引用37,含自引2

[9] Luo X, Li L, Chai M, Zhang Q, Shang G*. Escherichia coli BL21(DE3) chromosome-based controlled intracellular processing system for fusion protein separation. J Microbiol Methods. 2015, 114:35–37. 基于基因组的TEV表达实现细胞内剪切而去除融合蛋白的标签

[8]樊丹,石牡丹,杨运文,尚广东*. 基于染色体的重组工程系统的改进,南京师范大学学报(自然科学版),201336(1):99–103.重组工程和归巢核酸酶I-SceI介导的大肠杆菌染色体基因敲除获得高重组效率的菌株

[7]杨运文,蒋伏欢,宋杰,尚广东*. 重组工程法敲除恶臭假单胞菌KT2440的染色体基因,南京师范大学学报(自然科学版),201134(4):96–101. 首次实现重组工程介导的KT2440基因敲除

[6]Wei M,Wang S, Shang G*. Biosynthetic Pathways and Engineering for Bioactive Natural Products.Curr Org Chem. 2010 Aug; 14(14):1433–1446.次级代谢产物PKSNRPS生物合成基因簇综述。Google Scholar引用4

[5]Song J, Dong H, Ma C, Zhao B, Shang G*. Construction and functional characterization of an integrative form lambda Red recombineering Escherichia coli strain.  FEMS Microbiol Lett.2010, 309(2):178–183.整合至大肠杆菌染色体的重组工程系统。Google Scholar引用10

[4]谢峰,朱蕾,尚广东*. DNA克隆载体的“三片段克隆法”改造策略,南京师范大学学报(自然科学版),200730(4):80–83.重组工程拼接两个片段至载体

[3]尚广东,李卓荣,王以光. N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac)醛缩酶的克隆、表达和活性测定,中国抗生素杂志,200429(7):391–393.大肠杆菌异源表达醛缩酶NanA,酶催化得到抗流感药物扎那米韦的前体化合物N-乙酰-D-神经氨酸

[2] Shang G, Dai J, Wang Y. Construction and physiological studies on a stable bioengineeredstrain of shengjimycin. J Antibiot (Tokyo). 2001, 54(1):66–73. Google Scholar引用32

12为博士学习期间构建我国首个基因工程抗生素可利霉素(曾用名:生技霉素,必特螺旋霉素)的基因工程高产菌株。获中国第四届新医药博士论坛优秀论文一等奖和北京市第五届青年优秀科技论文二等奖。可利霉素(Carrimycin,商品名必特)于20196月获得国家一类新药证书,用于治疗上呼吸道感染

[1] 尚广东,戴剑漉,王以光. 生技霉素稳定型基因工程菌的构建,生物工程学报,199915(2):171–175. 

 

审稿

Molecular BiotechnologyCurrent Organic ChemistryDrug Design, Development and TherapyScientific ReportsMolecular Biotechnology;南京师范大学学报、药学学报、浙江农林大学学报

 

毕业生去向

2020.7毕业32名硕士研究生。1名南京大学博士毕业在高校,1名中国医学科学院博士毕业后在公司,1名毕业直接去高校,2名在行政事业单位,2名在事业单位,1名自主创业,15名在公司,9名在学校当教师。5名为山东齐鲁制药、南京京达、苏州金唯智以及苏州创胜等公司部门负责人。2019年和2020年连续两年的三年级硕士研究生均获得国家奖学金

 

E-mail: shanggd@hotmail.com

 

通讯地址210023,江苏省南京市栖霞区文苑路1号南京师范大学生命科学学院